常綠大喬木，樹可達60 公尺，徑可達 6 公尺或更大，樹皮薄，灰褐色至紅褐色，常在老樹上呈縱條狀剝落，樹枝擴展，小枝扁平。葉鱗片狀，在小枝側作覆瓦狀對生，先端銳尖，表面綠色，有時帶有古銅狀綠色，背面淡白色，並具有白色凹溝。雌雄同株，球花單生於短枝頂端；雄花黃色，雄球花小孢子葉 3~4 對；雌花球形，有珠鱗 3~6 對，開花期為2~3月。毬果橢圓形，果鱗盾形，種子略有翅，徑約 0.3 公分，9~10月結果，11月成熟。

喜歡涼爽、潮濕的環境。以種子繁殖。

可做庭園景觀樹、造林樹或行道樹。木材供建築、家具、棺木、雕刻及裝飾材。紅檜全株可提煉檜木油，可入藥。

台灣特有種，生長於全島中至高海拔約 1,200~2,800 公尺的山地，常形成大面積純林或與台灣扁柏混生。台灣針葉樹五木之一。日文的Hinoki，指的其實是日本扁柏，稱台灣扁柏則是「台湾ヒノキ（Taiwann hinoki）」，也就是俗稱的黃檜。而紅檜，在日文中的名字則是「タイワン（Taiwan）ベニ（beni）ヒノキ（hinoki）」，又簡稱「べニヒ（benihi）」，「ベニ（beni）」在日文中指的是「紅色」。順帶一提，「ヒノキ（Hinoki）」名稱的由來是因爲扁柏富含樹脂，有著一點即然的特性，所以被稱為「火の木（Hinoki）」。台灣原有大量的原始紅檜林，從日據時代開始，經數十年的砍伐，蓄積量已大量減少，目前僅在較僻遠地區有原始林的生長。